医保卡的扣费方式主要涉及以下几种情况：
当住院费用中个人自付部分小于医保个人账户余额时，这部分费用将直接从医保个人账户中扣除。
如果个人账户余额不足以支付个人自付部分，不足的部分需要个人用现金支付。
当住院费用中个人自付部分超过医保个人账户余额时，超出的部分将由医保统筹基金支付。统筹基金支付的部分通常按照一定的比例，根据当地医保政策来确定。
住院费用医保卡扣费通常是一次性扣除的。也就是说，在出院时，个人自费的费用自己支付，医保报销的部分由医保卡直接扣除。
药物和治疗费用中，有些可以医保直接报销，有些需要个人自费。住院费用中个人自付的部分，优先由医保个人账户余额抵付，不足部分再由个人支付现金。
在定点医院就医时，个人不需要先支付再报销，直接由医保和医院结算医保报销的部分。只在结账时，自付部分由自己用医保卡余额或现金支付。
住院报销有起付线，起付线以内的费用需要个人支付。超过起付线的部分才能根据当地医保的规定报销，报销比例各地不同，一般在80%左右。
总结起来，医保卡的扣费方式主要根据费用性质（个人自付或医保统筹基金支付）和账户类型（个人账户或统筹账户）进行一次性扣除。个人在住院费用中需要先自付一部分，剩余部分根据医保政策由个人账户或统筹基金支付。门诊费用则可以直接使用医保卡进行结算，自付部分在结账时支付。