申请连锁机构的营业执照，需要遵循以下步骤：
确定公司类型、名称、注册资本、股东及出资比例。
在线或现场提交核名申请。
填写《个体工商户设立登记申请书》。
提供申请人身份证明、经营场所证明等。
提交国家法律、法规规定提交的其他文件，如特殊行业许可证等。
将所有准备好的材料提交到工商行政管理局的工商注册登记窗口。
提交的材料应包括核名通知书、公司名称核准书、公司章程、股东会决议等。
等待工商部门的审核，审核通过后领取营业执照。
领取营业执照后，核对信息是否正确。
到公安指定的刻章点办理公司公章、财务章、合同章、法人代表章、发票章等。
开设银行账户，并到税务部门办理税务登记，领取发票。
如果涉及特殊行业，如餐饮、化妆品等，还需办理相应的健康证件和其他前置审批。
持续遵守相关法律法规和商务部门的规定，确保特许经营活动的合法性和规范性。
建议
提前规划：提前准备好所有必要的文件和资料，确保一次性通过审核。
咨询专业人士：在注册过程中遇到问题时，可以咨询专业的律师或会计师，以确保流程顺利进行。
关注政策：关注当地工商部门和税务部门的最新政策，及时调整申请策略。