在部队住院的流程如下：
军人需持门诊医生开具的住院通知单。
到挂号窗口办理手续后，去相应科室住院。
退役军人需携带身份证和优待证进行登记，并通过系统录入相关信息。
非体系军人需携带军人保障卡、有效身份证件及行政介绍信（同城双体系人员还需持第一体系医院转诊单）。
军人住院期间需统一着病号服，不得将军服、病号服和便服混穿，不得离开医院。
如有特殊情况需临时离开，需由伤病员所在单位领导向医院医务部门说明情况。
退役军人可以享受费用减免优惠，在结算时出示优待证。
军人免费医疗就诊，持军人保障卡可在全军所有后方医院门诊就医，住院治疗也享受免费待遇。
军人服现役年限视同职工基本医疗保险缴费年限，与退役后参加职工基本医疗保险的缴费年限合并计算。
转院治疗需通过全军转会诊平台审批。
建议：
军人及其家属在住院前，应提前了解并准备好所有必需的文件，以确保流程顺畅。
如果是非体系军人或需转诊，应提前了解并遵循相关流程和审批手续。