根据我国的相关劳动法律法规，公司扣员工工资一般不得超过当月工资的20%。同时，扣发完工资之后，剩余的工资不能低于当地的最低工资标准。
具体来说，如果员工当月工资是5000元，那么公司最多只能扣1000元作为赔偿或罚款。如果扣除后剩余的工资低于当地月最低工资标准，公司则需按照最低工资标准支付工资。
需要注意的是，如果员工因个人原因给单位造成经济损失，用人单位可以依照劳动合同的约定要求员工赔偿经济损失，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。此外，公司在扣工资时需要有正当理由，并且需要提前告知员工扣除的原因及数额。
综上所述，公司扣员工工资的上限是当月工资的20%，并且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。