在南通，如果机动车违章查询结果有误，可以通过以下步骤进行申诉：
提交行驶证、驾驶证、身份证等资料。
领取违章处罚决定书。
携带行政复议申请表、处罚决定书、驾驶证、行驶证、身份证等资料到当地的公安部门提交申请。
在七个工作日内给予答复以及相应的措施。
另外，查询违章记录可以在车管所自助终端，也可以在交管12123APP和公安部交通安全综合管理平台进行。
建议：
提前准备好所有需要的资料，确保资料齐全。
选择就近的车管所或公安部门进行申诉，以节省时间和精力。
如果对违章内容有疑问，可以先在车管所或交警队查询确认，再提出申诉。