处理黑心作坊的方法如下：
组织小组成员以监管网格为单位，重点检查群众反映的小超市，查看是否存在售卖“三无”食品的情况。
对于发现的问题，进行批评教育并按规定处罚，同时要求小超市提供相关违法线索。
针对检查中发现的黑心作坊，依法取缔关停，并责令整改。
对于未发现问题的经营主体，加强宣传，增强其食品安全意识，要求其规范合法经营。
进行回头检查，加强监督检查力度，形成长效机制。
督促经营主体严格落实食品安全主体责任，加强对“三无”产品的管理，确保经营产品符合相关规定。
食品黑作坊若生产、销售不符合食品安全标准的食品，足以造成严重食物中毒事故或其他严重食源性疾病，主要负责人将被处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金。
生产、销售伪劣产品，销售金额五万元以上不满二十万元的，处二年以下有期徒刑或拘役，并处或单处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金。
可以向当地工商局、110报警，并使用公证云软件拍摄录像记录不法行为，作为出庭证据。
消费者主张生产者或经营者承担惩罚性赔偿责任的，人民法院应予支持。
对于明知从事违法生产经营行为仍提供便利条件的单位或个人，消费者有权主张其与食品生产经营者承担连带责任。
小作坊违规生产将受到责令停止产销、没收违法产品，并处货值金额等值以上三倍以下罚款，有违法所得将没收。
情节严重者，将吊销营业执照，构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。
综上所述，处理黑心作坊需要综合运用监管检查、法律手段、举报与记录、消费者维权及行政处罚等多种方法，形成合力，确保食品安全。